市粮食局设8个内设机构:
(一)办公室。
组织协调局机关的政务工作，拟订局机关工作规则并组织实施;负责局机关的文秘、机要、保密、档案、政务值守、信访、政务信息、宣传报道、电子政务、会务、督查、建议提案办理、综合协调、公务接待和政务公开工作;负责局机关和所属企事业单位的保卫工作和社会治安综合治理的日常工作。
(二)调控科。
研究提出全市粮食宏观调控、总量平衡、粮食购销的建议;拟订市级储备粮油的规模、总体布局和收购、销售、轮换意见并组织实施;审批并核查粮食收购资格;负责全市粮食流通统计、粮食供求平衡调查、军粮供应、市场监测和预警分析工作。
(三)政策法规科。
研究提出全市粮食流通体制改革方案及相关政策措施并组织实施;负责粮食工作重大问题和重要政策、法规的研究工作;组织粮食流通和储备等相关配套政策制度的起草和宣传;承担相关行政复议、行政应诉等工作。
(四)监督检查科。
监督检查全市粮食流通管理的法律、法规、政策和规章制度的贯彻执行情况;监督检查地方储备粮计划、数量、质量和技术规范的执行情况;组织指导对全市粮食经营者从事粮食收购、储存、运输活动和政策性用粮的购销活动以及执行国家粮食流通统计制度情况的监督检查;承担全市粮食库存检查工作。
(五)财务科。
承担局机关和所属单位部门预算、财务管理、政府采购、国有资产监管和内部审计工作;指导全市粮食企业贯彻国家有关财税、金融、会计政策;协调落实有关财政补贴政策和粮油收购资金供应;指导粮食财务挂帐管理和消化、以及企业改革有关财务工作。
(六)仓储科。
拟订全市粮食流通基础设施建设和仓储管理的相关政策并组织实施;承担全市粮食仓储管理和储存工作;承担中央和地方储备粮承储资格的申报、认定工作。
(七)产业发展科。
拟订全市粮油工业发展规划，指导全行业粮油工业发展的具体业务工作，拟订有关制度、办法并监督执行，对粮食产业化发展基金进行监管，组织粮油工业科技推广和交流合作。
(八)人事科(党委办公室)。
负责局机关和所属单位党的建设、干部管理和精神文明建设;负责管理局机关和所属单位机构编制、人事劳资;组织指导全市粮食行业的职业教育和干部培训等项工作。
纪检机构 按有关规定设置。
离退休干部科 负责局机关离退休干部工作，指导所属单位的离退休干部工作。