棉籽油中毒的后遗症是对生殖系统的损害。导致男性生殖系统长期不育，女性出现月经不调或闭经以及子宫萎缩。实验研究表明，大鼠食用含毛棉籽油的饲料4个月左右，睾丸明显缩小，精细胞显著减少甚至消失。子宫缩小，内膜及腺体萎缩，卵巢轻度萎缩，肾实质细胞有轻度浮肿。成年男子服用毛棉籽油的提取物棉酚40天，每天60-70毫克，短期内精子全部被杀死，并逐渐从精液中消失。长期多量食用粗制棉籽油，还可使人患日晒病，表现症状为晒后发作，全身无力或少汗，皮肤灼热、潮红，心慌气短，头昏眼花，四肢麻木，食欲减退。据说有精炼工艺可以减毒。另外，可影响男性性腺健康或引发睾丸萎缩的还有茶籽油、葵花子油等。

    1、我国学者发现，食用粗制棉籽油可造成生精细胞损害，导致睾丸萎缩，而无精子产生，造成不育。我国曾有产棉区的农民因长期多量食用粗制棉籽油后，导致睾丸萎缩，而造成不育。

    2、棉籽油是从种棉籽中压榨而得的油脂，是很强的杀精。棉籽主要含有棉籽油酚，这是一种含酚毒甙，棉籽油酚对肝、血管、肠道及神经系统毒性较大。游离棉酚还能影响男性大多数性欲减退。