确保干菜彻底干燥后再密封。购买或自制干菜后，可在晴天摊开晾晒半天，用手捏感觉干硬、无湿润感。若干菜有余温就装入袋中，内部水汽会引发霉变。晾凉后立即分装。
选用密闭性好的容器并放入干燥剂。玻璃罐、食品级密封罐或厚实铝箔袋均可。罐底放一小包食品用硅胶干燥剂或几块充分晒干的竹炭，再装入干菜，盖紧盖子。梅干菜等易吸味的干菜可用真空密封机抽气保存，效果更稳定。
利用天然材料驱虫防潮。在容器中放入几粒干花椒或一小把干茶叶（用纱布包好），花椒的气味能驱赶米虫、豆虫，茶叶可以吸收多余湿气。注意每两月更换一次花椒和茶叶，以免失效。
低温环境延长保存期。将密封好的干菜放入冰箱冷藏室（0-4℃），温度稳定且湿度低。若空间充足，也可放入冷冻室（-18℃），冷冻后的干菜无需解冻，直接取出泡发使用，一年后风味依然良好。冷藏或冷冻前务必密封严实，避免串味。
定期检查并隔离问题干菜。每隔两个月打开容器查看一次，若发现个别干菜表面有白斑或闻到酸味，立即取出丢弃，并将剩余干菜重新晾晒半天后再装回。存放时遵循“旧菜放上面、新菜放下面”的原则，先吃完存放较久的批次。